La découverte du point faible du SARS-CoV2

Les propriétés de l'ARN polymérase du virus et autres actualités scientifiques.

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Dans une étude parue dans Nature Communications, une équipe du CNRS a découvert le point faible du SARS-CoV2 : son ARN polymérase. La polymérase est une enzyme qui est codée par le génome du virus et qui est chargée de faire une copie fidèle de son matériel génétique ; dans le cas du coronavirus, il s'agit d'une longue molécule d’ARN. Parfois, il y a des erreurs, mais cette polymérase est capable de réparer les erreurs qu’elle fait pour assurer une stabilité génétique. Ces chercheurs ont mis en évidence que pour le SARS-CoV 2, cette polymérase est extrêmement rapide. Elle est 10 fois plus rapide que chez le virus de l’hépatite C par exemple, alors que la molécule d’ARN du coronavirus est trois fois plus longue. L’avantage pour le virus, c’est que cela laisse moins de temps au système immunitaire pour le détecter. Mais cet atout est aussi "un talon d’Achille". 

Bruno Canard, directeur de recherche au CNRS à l’université Aix-Marseille, est l’auteur principal de cette étude. Il montre que certaines molécules qui agissent sur la réplication virale peuvent pousser le virus à commettre des « erreurs catastrophes ». 

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The Lancet et sa nouvelle politique d’évaluation par les pairs 

La revue britannique The Lancet va renforcer l’évaluation par les pairs. Cette décision fait suite au « Lancetgate » ; quand le 4 juin dernier, la revue avait dû rétracter un article douteux à propos de l’hydroxychloroquine. Avant d’être publiée, une étude est soumise à un comité de lecture - où des chercheurs vont juger les travaux de leurs pairs, c’est la fameuse évaluation par les pairs. Dorénavant, la revue exigera une plus grande transparence et un meilleur partage des données des études évaluées. Au moins un de ces examinateurs devra « être au courant des détails de l’ensemble de données rapportées ». Les éditeurs déclarent aussi porter plus d’attention aux éventuels soupçons sur l’intégrité d’une recherche. De plus, les pré-publications seront acceptées, pour que n’importe qui puisse les examiner.

Référendum : les chasseurs manifestent devant

la permanence du député Laurent Garcia

Le député a signé une pétition demandant un référendum d'initiative partagée contre la maltraitance animale.

Une cinquantaine de chasseurs ont pris part à la manifestation. Photo ER /Jean-Christophe VINCENT

Selon la préfecture, la neige pourrait tomber dès 1600 m en début d'après-midi. Une limite qui devrait descendre à 1300m en fin de journée. Les cumuls de neige attendus vont de 10 à 30 cm. Le tout doublé de rafales de tramontane pouvant aller jusqu'à 100 km/h, dans la nuit de vendredi à samedi. 

De son côté, Météo Pyrénées annonce 72h de précipitations sur les Pyrénées (supérieures à 150-200 mm) avec des "chutes de neige bien précoces" (1500/1700m) et des "cumuls sans doute pas vus depuis au moins 15 ans pour un mois de septembre". 

(15 ans pour les cumuls de neige pas de pluies

Coronavirus - Une soixantième victime du Covid-19 déplorée dans l'Aude, 7852 nouveaux cas détectés en 24h en France

Vers de la grappe, Pourriture grise, oïdium…

L'état sanitaire décroche dans quelques vignobles

Dans le Sud, l’oïdium a fait éclater quelques baies de raisin en août mais le phénomène est resté ponctuel. - crédit photo : UMR Save INRA

Si l’état sanitaire est resté très bon à Bordeaux, en Alsace, ou dans les Côtes du Rhône, certaines parcelles du Val de Loire sont touchées par la pourriture grise et l’oïdium. Dans le Sud, les vignerons doivent se méfier des vers de la grappe.

Tous les vignerons ne sont pas logés à la même enseigne. En Alsace, les quelques foyers de botrytis qui s’étaient développés sur pinot gris et riesling après l’épisode humide de la fin août ont tous séché. « Les 15 à 30 mm de précipitations ont fait du bien à la vigne sans dégrader l’état sanitaire » indique Frédéric Schwaerzler, conseiller viticole à la Chambre d’agriculture.

A Bordeaux, Damien Clerdan, conseiller dans l’Entre-Deux-Mers, voit aussi un peu de pourriture grise. « Mais vraiment pas de quoi s’affoler, les conditions météorologiques ne sont pas favorables aux champignons. Il y a quelques foyers dans des parcelles de muscadelle ou de sémillon très chargées mais globalement, le vignoble reste très sain, même là où il y a des vers de la grappe. »

Aspergillus sur le littoral languedocien

Les vers de la grappe sont également présents en Occitanie, essentiellement sur la zone littorale, de l’Aude au Gard, et dans les parcelles qui n’ont pas été assez protégées. « Il s’agit en majorité d’eudémis, et dans une moindre mesure de cryptoblabes », rapporte Jacques Rousseau, expert viticole à l’Institut Coopératif du Vin.

Contrairement à ce qui est observé dans le bordelais, dans le Sud, « à chaque fois qu’il y a des vers, il y un développement d’aspergillus carbonarius, avec une poussière noire sur le raisin, et un risque de teneurs élevées en ochratoxines dans les vins. »

C’est le seul point de vigilance. Jacques Rousseau témoigne d’un très bon état sanitaire sur l’ensemble de la région, et dans les Côtes du Rhône. « L’oïdium a bien fait éclater quelques baies en août mais le phénomène est resté ponctuel. » Les vendanges sont désormais bien avancées. Les viticulteurs sont en train de rentrer les premiers cabernets et carignan.

La situation est plus mitigée dans le Val de Loire. « Nous voyons de l’oïdium sur des parcelles de chenin, sauvignon et, plus ponctuellement de chardonnay, essentiellement chez les viticulteurs qui n’ont pas traité en juillet de peur de griller les baies » affirme Florent Doublier, gérant du laboratoire Litov, dans le vignoble de Saumur. « A l’inverse, beaucoup de secteurs sont restés super sains. Que ce soit en termes de maturité, de charge ou d’état sanitaire, l’hétérogénéité est le maître mot du millésime. »

Mauvaise surprise

La bactérie Xylella fastidiosa est arrivée en Occitanie

L'insecte Philaenus spumarius serait le vecteur de Xylella fastidiosa. - crédit photo : Wikimedia

La bactérie Xylella fastidiosa a été détectée dans l’Aude chez un pépiniériste. Une enquête et des analyses sont en cours pour déterminer l’origine de l’infection et la sous espèce concernée. Tous les végétaux sensibles de la zone vont être arrachés.

« Nous connaîtrons d’ici peu la sous-espèce de la bactérie Xylella fastidiosa découverte dans l’Aude » annonce Jacques Grosman, expert national vigne à la Direction générale de l’Alimentation. « Touchons du bois pour que ce soit multiplex, et non fastidiosa, responsable de la maladie de Pierce sur vigne. »

Des analyses sont en effet en cours suite à la découverte fin août, lors d’une inspection de routine des services de la protection des végétaux du ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation, de la bactérie chez un pépiniériste sur la commune de Trèbes, près de Carcassonne, dans l’Aube.

C’est une première en Occitanie. « Jusqu’à présent, seules deux régions présentaient des foyers de la maladie en France : la Corse et la Provence-Alpes Côte d’Azur » rappelle le ministère dans un communiqué.

Arrachage de tous les végétaux sensibles

« L’enquête de traçabilité est en cours afin de déterminer l’origine de l’infection et des prélèvements sont réalisés sur l’ensemble des autres végétaux sensibles à la bactérie situés dans la zone infectée afin de déterminer l’ampleur de l’infection » indique le Ministère.

Conformément au plan national d’intervention sanitaire d’urgence, l’ensemble des végétaux sensibles à Xylella fastidiosa présents dans un rayon de 2,5 kms autour du site seront arrachés dans les prochains jours pour éviter la prolifération de la bactérie. Selon la sous-espèce en présence, les vignes plantées dans la zone seront concernées. Le ministère promet d’indemniser les entreprises touchées.